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差异代谢物的筛选

2023年01月11日 08:40

我的实验设计是在黑蒜发酵过程中间隔固定时间取样,然后做代谢组筛选发酵过程中的差异代谢物。我已经使用simca做了OPLS-DA得到了VIP值,还需要得到P值才能筛选差异代谢物。由于我的simca版本老旧,并不能进行students t检验,所以我想要使用excel或者SPSS来做t检验。我在查阅教程时发现t检验是两组样本之间进行的,而我的样品依时间分为10组,OPLS-DA也是10组一起做的。现在我的疑问是t检验可以在10组之间做吗,如果不行的话该如何筛选差异代谢物呢?两两检验吗?如果是两两之间比较的话OPLS-DA是不是也需要在两两之间做呢?或者,如果您能提供simca 16就更好了

来源:网络

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